Ett avsnitt inom genetikområdet är en DNA-molekyl som kan replikera autonomt i värdcellens cytoplasma, och som fysiskt integreras i värdcellens kromosom, replikeras också som en enda molekyl (vid som vi kallar cointegrated).
Avsnittet kan därför tolkas som en form av samexistens och inte som en typ av replikon. Faktum är att för vissa författare kan transposoner och insättningssekvenser betraktas som episoder, eftersom de effektivt bärs på värdcellens kromosom, även om de aldrig har en oberoende och autonom existens i cytoplasma.
I eukaryota celler avser däremot episome mer virala replikoner som samexisterar som plasmider i infekterade celler än till virus som kan integreras i värdcellens genom.
Detta är inte det enda fallet där samma ord betyder olika saker i eukaryoter och prokaryoter (till exempel termen transformation). Episoder har en rik historia i utvecklingen av modern genetik, eftersom de hjälpte till att upptäcka intressanta fenomen relaterade till ärftlighet.
Avsnitt som är bakteriofager
Ett annat av de mest kända exemplen på episoder är fruktbarhetsfaktorn eller plasmiden F. Ibland rekombineras den cirkulära plasmiden, beroende på nukleotidsammansättningen av värdbakterien (t.ex. E. coli), med homologa platser närvarande på kromosomen. av bakterien som ger upphov till ett kointegrat.
Det vill säga, plasmiden kan replikera i lågt kopietal i bakteriens cytoplasma, eller om den är integrerad, kan den replikeras som en helhet i ett kopienummer motsvarande det för bakterien utan F (vanligtvis en).
I sitt episontillstånd ger F bakterierna förmågan att producera ett stort antal rekombinanter efter konjugeringsprocessen.
En F + -bakterie (det vill säga som har en autonom F-plasmid) som genomgår införandet av detta element sägs vara Hfr (för hög frekvens av rekombination, för dess akronym på engelska), eftersom det genom en konjugeringshändelse är teoretiskt kan "dra" hela bakteriekromosomen in i en F-bakterie (det vill säga saknas fertilitetsfaktorn eller plasmiden F).
I allmänhet är de sekvenser som tillhandahåller homologin (och därför likhet och komplementaritet) mellan F-plasmiden och bakteriekromosomen så att den platsspecifika rekombinationsprocessen som ger upphov till cointegratet verifieras, insättnings-sekvenser.
Avsnitt i eukaryota celler
Av historiska skäl var termen episom (ovan + kropp) alltid kopplad till plasmidens ursprung, som ursprungligen härstammar från världen av extrakromosomala element i prokaryoter.
När man hittade liknande element i eukaryoter antogs användningen av samma för att beteckna molekyler av virusgenom som kan självreplicera i denna typ av infekterade celler med egenskaper som liknade de för plasmider i prokaryoter.
Det vill säga, i eukaryota celler infekterade med virus kan vi i vissa fall konstatera att viruset, som en del av dess replikativa cykel, existerar i cellen som en cirkulär DNA-molekyl som liknar dessa andra replikoner som beskrivs i till exempel bakterier.
De mest kända virusen som kan samexistera som autonomt replikerande cirkulära DNA-molekyler (från värdkromosomen) tillhör familjerna Herpesviridae, Adenoviridae och Polyomaviridae.
Ingen av dem är emellertid integrerad i värdgenomet, varför det kan anses att de replikeras som plasmider och att de inte uppfyller den inneboende kvaliteten som kännetecknar ett episom: integrera i värdgenomet.
Även om avlägsnandet av termen har föreslagits, kommer det kanske bara att ge förvirring till ett ämne som redan är ganska komplicerat i sig.
Slutsatser
Sammanfattningsvis kan vi säga att en episod, etymologiskt sett, är ett genetiskt element i autonom replikering som kan samexistera i cellen som en fri DNA-molekyl, eller fysiskt integrerad i värden.
Ur genetikens synvinkel är emellertid en episom en plasmid eller virus som kan integreras i det prokaryota genomet, eller vara en av de typer av plasmider som en eukaryotisk cell kan innehålla.
Intressant nog anses virus som kan infoga i genomet av den eukaryota värden (retrovirus) inte vara episoder.
referenser
- Brock, TD 1990. Emerging of Bacterial Genetics. Cold Spring Harbour Laboratory Press. Cold Spring Harbor, MA, USA.
- Griffiths, AJF, Wessler, SR, Carroll, SB & Doebley, J. Introduktion till genetisk analys. WH Freeman & Co, McMillan Publisher. London, Storbritannien.
- Hayes, W. 1971. Genetics of Bacteria and their Viruses, Second Edition. Blackwell Scientific Publications.
- Jacob, F. & Wollman, EL 1958. Les episoder, element génétiques ajoutés. Kommer Rendus de l'Académie des Sciences de Paris, 247 (1): 154–156.
- Levy, JA, Fraenkel-Conrat, H. & Owens, OS 1994. Virology, 3rd Edition. Prentice Hall. Englerwood Cliffs, NJ, USA.